在抑郁症的治疗中，目前多是采用药物治疗，辅以心理治疗等。对于抑郁症状严重，自伤自杀倾向严重的患者，可以合并应用无抽搐电休克治疗治疗快速控制以及改善抑郁情绪。经颅磁刺激目前尚未作为单一治疗手段应用于临床治疗抑郁症，只是作为一种治疗的辅助手段。一般来讲，一个治疗周期为10-12次。有研究表明，经颅磁刺激作用在1-2周内快速起效，比大多数药物的起效时间都要快。如果不给予持续治疗，这种疗效持续的时间也短。有些研究报道在1-2周内即可复发，因此，在抑郁症的治疗手段中，除了保证初期的治疗疗效外，我们应该更关注如何防止复发的问题。目前来讲，防止复发一般是予以服用抗抑郁剂维持治疗。