雷公藤全植物均有毒，毒性与其所含生物碱及二萜环氧化合物有关。根皮毒性较木质大。毒性与采收季节有关。以夏天采收的毒性较大。各种动物对雷公藤的毒性反应不同。人对雷公藤毒性敏感。

　　雷公藤的主要毒副作用为胃肠道反应、月经紊乱、骨髓抑制、皮疹、肝功能异常等。一般情况下，这些反应的发生率很低。毒副作用还与制作工艺、药品的纯度有关系。

　　中毒症状主要表现为剧吐、腹绞痛、腹泻、心音弱快、心电图改变、血压下降、体温降低、休克、尿少、浮肿、尿液异常。后期发生骨髓抑制、粘膜糜烂、脱发等，个别可有抽搐。主要死因是循环衰竭及肾功能衰竭。死亡可在24小时内，一般不超过4天。

　　副作用与中毒表现仅为程度上的差别。抗生育作用表现为精子活力降低，数量减少。在一定的总剂量下，为可逆性。所以，用雷公藤制剂治疗银屑病应在有经验的医生观察指导下使用，定期做一些必要的化验，及时调整剂量，达到最安全、最好的疗效。

　　由于雷公藤适应证范围广，疗效较高。从临床应用来看，多数病人对雷公藤均能耐受。有的服用数年仍能耐受，但雷公藤毒性大，应用时仍应时刻注意以下几点：①掌握好剂量。由小剂量开始逐渐增量；②对年老体弱或儿童要慎用或减量使用；③对心、肝、肾器质性病变，功能不良者、白细胞低、孕妇及哺乳妇女忌用；④饭后服用或合用保胃药，以及维生素B6等可以减轻消化道反应；⑤用药过程中定期查血象；⑥因药用部位与毒性大小有关，为减少不良反应，须严格去净二层根皮，用其木质部分；⑦煎药以文火久煎可减少毒性，一般要煎2～3小时以上。