任何药物都有或多或少的副作用，降脂药（尤其是他汀类和贝特类）也不例外。在服用降脂药的过程中，少数患者可出现腹部不适，恶心，厌食，呕吐和便秘等症状，一般并不严重，可以耐受。除了上述常见的副作用外，少部分人在服用了降脂药后还会有转氨酶的升高，所以在服用降脂药时需要监测肝功，尤其服药后前1～3个月，如果在服药初期没有表现出肝损害，则以后出现的可能性很小。另一种比较少见的副作用是引起肌病，一般在大剂量应用他汀类药或者联用2种以上降脂药时（如他汀类和贝特类）出现，所以一旦出现原因不明的肌肉酸痛或无力应及时就诊，由医生判断是否为降脂药引起的肌病。

    很多患者总是认为西药尤其是他汀类药会引起肝脏损害，不敢使用他汀类药物。其实这完全是误解。首先肝脏作为解毒器官，大部分药物甚至食物都是经过肝脏分解代谢的，他汀类药也是经过肝脏代谢，确实有部分高脂血症患者在服用他汀类药后，出现了转氨酶升高，但大都是一过性的。事实上，肝酶异常和肝功能不全并不是一回事，他汀类药治疗中出现的肝功能异常通常是一过性、无症状性的转氨酶增高，并不代表存在他汀类药相关的显著肝脏损伤，他汀类药相关肝功能衰竭的发生率仅1/1000000左右。绝大多数患者使用他汀类药都是安全的，并且已有研究证实在合并脂肪肝的患者中使用他汀类药调节血脂，不仅没有使转氨酶继续升高，反而可以使转氨酶下降，并明显减少这部分患者的心血管风险。而且他汀类药给高脂血症患者带来的好处远远大于其副作用。