多数情况下禁忌证是相对的，病人在术前应充分了解检查的必要性以及检查时的情况以消除紧张情绪，但有以下情况的病人是不能行内镜检查的：①严重心肺疾病，无法耐受胃镜检查者；②怀疑有胃肠穿孔者；③腐蚀性食管炎、胃炎；④急性重症咽喉部疾病，内镜不能插入者；⑤生命处于休克或其它危重状态者；⑥不能合作的精神病患者或严重智力障碍者。