蛋白质在肠道的腐败作用对于肝性脑病的发生具有重要的促进作用，而蛋白质腐败作用是通过肠道内细菌进行的，使用抗生素抑制这些细菌，就可以减少由于蛋白质腐败作用而产生的有害物质。因此，肝性脑病时选择的抗生素应该是肠道几乎不吸收或很少吸收的，抗生素可以更多地进入大肠发挥更好的作用。另外，使用抗生素还可抑制产尿素酶的细菌，减少肠道内氨的产生，有利于肝性脑病的预防与治疗。