由于儿童乙型肝炎病毒（HBV）相关性肾炎有一定的自发缓解倾向，轻症患儿采用利尿消肿等一般对症治疗也有可能获得缓解。抗病毒治疗是儿童HBV相关性肾炎的主要治疗方法。可使用重组干扰素抗病毒治疗。干扰素可以出现一些不良反应，对不耐受或不愿意干扰素注射治疗的儿童可采用口服拉米夫定抗病毒治疗。儿童类固醇激素治疗HBV相关性肾炎的肾病综合征，在减少尿蛋白上虽有时可获短期效果，但多数无效。而且激素治疗却可促进HBV的复制而加重病情，故此药需慎用。