肾活检是一种创伤性检查，有一定危险，可能会产生一些并发症，其并发症以创伤性出血为主，如血尿、肾周血肿、腰痛及动静脉瘘，还可能损伤其他器官，如肝、脾、结肠、十二指肠、胰腺、胆囊、肾上腺、输尿管、肠系膜动脉、胸膜腔等。但由于现在均采用超声引导下肾活检穿刺，使上述并发症的发生率大大降低，特别是在一些有经验的肾科几乎无明显严重的并发症出现。一般孩子肾活检后经过卧床休息、止血、预防性抗生素应用，均很快恢复，无后遗症发生。