孩子得了脑炎以后，可能出现各种脑炎后遗症，影响以后的生活。化脓性脑膜炎急性期如有严重抽搐、长时间神志不清和其他明显脑损伤的表现，可能出现脑功能轻微障碍综合征，轻或重度精神发育迟缓、语言发育障碍、脑积水、运动功能障碍、听力障碍、偏瘫、癫痫等。病毒性脑炎的预后与病变范围和病情轻重有关。如果昏迷时间长、有频繁惊厥者，脑部缺氧及病理变化加重，预后多较差，容易留有神经、精神后遗症。胎儿经胎盘感染单纯疱疹病毒后可发生小脑畸形，先天性风疹病毒感染患儿可发生小头畸形、耳聋，甚至进行性精神及运动障碍，严重影响生活质量。