由于儿童防御、免疫功能较成人弱，病原菌容易通过血脑屏障到达脑膜引起化脑。婴幼儿的皮肤、黏膜、胃肠道以及新生儿的脐部也是感染的侵入门户，鼻窦炎、中耳炎、乳突炎既可以作为病灶窝藏细菌，也可因病变扩展波及脑膜。化脑也可通过颅骨外伤、骨折的并发症，特别是那些涉及鼻道的骨折更可能形成颅内与外界的直接通道，成为细菌侵入的门户，一些孩子如果有皮样囊肿或脑脊髓膜膨出也易患脑炎。如果儿童有先天免疫缺陷因素，如细胞免疫缺陷、联合免疫缺陷、血清补体成分缺乏、血清备解素减少等，都会影响孩子的预防感染能力，容易发生脑炎。