腰椎穿刺术简称腰穿，是神经科的基本操作。要明确颅内感染的病原，就要通过腰椎穿刺并对脑脊液进行生化及病原学检测。此种方法是医学的常规检查手段，也是其他检查所不能取代的。其主要作用是通过腰椎穿刺获取脑脊液，根据脑脊液的外观、压力、细胞数、蛋白质、糖及氯化物含量的多少，采取涂片找细菌、细菌培养、病毒及各种酶含量测定来判断中枢神经系统感染的性质，制订下一步的诊疗计划。例如：根据脑脊液的外观、白细胞数，蛋白质、糖和氯化物的含量，确定感染是化脓性、结核性或是病毒性，适时选用敏感的抗生素或抗结核药物治疗及对症治疗。另外为了了解治疗效果、评估病情的转归，调整进一步的治疗方案，有些患者需要在治疗过程中定期复查脑脊液，还有些严重的结核菌或真菌感染的患者治疗需要腰穿鞘内注射用药。